Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Upp1P52624 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Upp1P52624 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Upp1P52624 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Upp1P52624 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Upp1P52624 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Upp1P52624 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Upp1P52624 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Upp1P52624 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Upp1P52624 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Upp1P52624 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Upp1P52624 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Upp1P52624 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Upp1P52624 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Upp1P52624 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Upp1P52624 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Upp1P52624 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Upp1P52624 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Upp1P52624 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Upp1P52624 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Upp1P52624 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Upp1P52624 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Upp1P52624 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Upp1P52624 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Upp1P52624 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Upp1P52624 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Upp1P52624 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Upp1P52624 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Upp1P52624 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Upp1P52624 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Upp1P52624 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Upp1P52624 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Upp1P52624 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Upp1P52624 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Upp1P52624 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Upp1P52624 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Upp1P52624 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Upp1P52624 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Upp1P52624 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Upp1P52624 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Upp1P52624 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Upp1P52624 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Upp1P52624 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Upp1P52624 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Upp1P52624 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Upp1P52624 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Upp1P52624 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Upp1P52624 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Upp1P52624 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Upp1P52624 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Upp1P52624 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Upp1P52624 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Upp1P52624 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Upp1P52624 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Upp1P52624 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Upp1P52624 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Upp1P52624 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Upp1P52624 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms