Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ClgnP52194 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ClgnP52194 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ClgnP52194 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
ClgnP52194 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ClgnP52194 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ClgnP52194 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ClgnP52194 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ClgnP52194 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ClgnP52194 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ClgnP52194 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ClgnP52194 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ClgnP52194 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ClgnP52194 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ClgnP52194 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ClgnP52194 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ClgnP52194 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ClgnP52194 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
ClgnP52194 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ClgnP52194 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ClgnP52194 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ClgnP52194 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ClgnP52194 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ClgnP52194 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ClgnP52194 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ClgnP52194 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ClgnP52194 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ClgnP52194 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ClgnP52194 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ClgnP52194 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ClgnP52194 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ClgnP52194 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ClgnP52194 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ClgnP52194 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ClgnP52194 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
ClgnP52194 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ClgnP52194 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ClgnP52194 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ClgnP52194 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
ClgnP52194 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ClgnP52194 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
ClgnP52194 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ClgnP52194 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ClgnP52194 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ClgnP52194 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ClgnP52194 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ClgnP52194 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ClgnP52194 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ClgnP52194 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ClgnP52194 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ClgnP52194 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms