Protein–RNA interactions for Protein: P51680

Ccr4, C-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr4P51680 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccr4P51680 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccr4P51680 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccr4P51680 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccr4P51680 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccr4P51680 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccr4P51680 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccr4P51680 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccr4P51680 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccr4P51680 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccr4P51680 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccr4P51680 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccr4P51680 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccr4P51680 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccr4P51680 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccr4P51680 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccr4P51680 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccr4P51680 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccr4P51680 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccr4P51680 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccr4P51680 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccr4P51680 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccr4P51680 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms