Protein–RNA interactions for Protein: P51612

Xpc, DNA repair protein complementing XP-C cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XpcP51612 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
XpcP51612 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
XpcP51612 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XpcP51612 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XpcP51612 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
XpcP51612 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
XpcP51612 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XpcP51612 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XpcP51612 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XpcP51612 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XpcP51612 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XpcP51612 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XpcP51612 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XpcP51612 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
XpcP51612 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XpcP51612 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
XpcP51612 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
XpcP51612 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
XpcP51612 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
XpcP51612 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
XpcP51612 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
XpcP51612 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
XpcP51612 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
XpcP51612 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
XpcP51612 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XpcP51612 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XpcP51612 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XpcP51612 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
XpcP51612 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
XpcP51612 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XpcP51612 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XpcP51612 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XpcP51612 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XpcP51612 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XpcP51612 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XpcP51612 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XpcP51612 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
XpcP51612 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XpcP51612 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XpcP51612 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XpcP51612 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
XpcP51612 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XpcP51612 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XpcP51612 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XpcP51612 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
XpcP51612 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XpcP51612 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XpcP51612 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
XpcP51612 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XpcP51612 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
XpcP51612 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XpcP51612 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XpcP51612 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XpcP51612 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XpcP51612 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
XpcP51612 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XpcP51612 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
XpcP51612 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XpcP51612 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
XpcP51612 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XpcP51612 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
XpcP51612 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XpcP51612 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
XpcP51612 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
XpcP51612 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
XpcP51612 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
XpcP51612 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XpcP51612 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XpcP51612 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XpcP51612 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XpcP51612 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XpcP51612 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XpcP51612 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XpcP51612 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XpcP51612 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XpcP51612 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
XpcP51612 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XpcP51612 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XpcP51612 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XpcP51612 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
XpcP51612 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XpcP51612 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XpcP51612 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XpcP51612 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XpcP51612 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
XpcP51612 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
XpcP51612 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
XpcP51612 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
XpcP51612 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
XpcP51612 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
XpcP51612 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
XpcP51612 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
XpcP51612 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
XpcP51612 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
XpcP51612 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
XpcP51612 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XpcP51612 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XpcP51612 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XpcP51612 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XpcP51612 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms