Protein–RNA interactions for Protein: P51450

Rorc, Nuclear receptor ROR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorcP51450 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RorcP51450 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RorcP51450 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RorcP51450 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RorcP51450 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RorcP51450 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RorcP51450 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RorcP51450 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RorcP51450 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RorcP51450 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RorcP51450 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RorcP51450 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RorcP51450 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RorcP51450 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RorcP51450 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RorcP51450 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RorcP51450 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RorcP51450 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RorcP51450 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RorcP51450 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RorcP51450 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RorcP51450 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RorcP51450 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RorcP51450 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RorcP51450 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RorcP51450 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RorcP51450 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RorcP51450 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RorcP51450 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RorcP51450 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RorcP51450 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RorcP51450 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RorcP51450 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RorcP51450 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RorcP51450 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RorcP51450 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RorcP51450 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RorcP51450 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RorcP51450 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RorcP51450 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RorcP51450 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RorcP51450 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RorcP51450 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RorcP51450 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RorcP51450 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RorcP51450 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RorcP51450 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RorcP51450 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RorcP51450 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RorcP51450 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RorcP51450 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RorcP51450 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RorcP51450 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RorcP51450 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RorcP51450 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RorcP51450 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RorcP51450 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RorcP51450 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RorcP51450 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RorcP51450 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RorcP51450 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RorcP51450 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RorcP51450 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RorcP51450 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RorcP51450 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RorcP51450 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RorcP51450 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RorcP51450 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RorcP51450 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RorcP51450 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RorcP51450 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RorcP51450 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RorcP51450 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RorcP51450 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RorcP51450 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RorcP51450 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RorcP51450 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RorcP51450 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RorcP51450 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RorcP51450 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RorcP51450 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RorcP51450 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RorcP51450 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RorcP51450 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RorcP51450 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RorcP51450 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RorcP51450 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RorcP51450 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RorcP51450 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RorcP51450 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RorcP51450 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RorcP51450 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RorcP51450 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RorcP51450 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RorcP51450 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RorcP51450 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RorcP51450 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RorcP51450 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RorcP51450 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RorcP51450 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms