Protein–RNA interactions for Protein: P50428

Arsa, Arylsulfatase A, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArsaP50428 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ArsaP50428 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ArsaP50428 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ArsaP50428 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ArsaP50428 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ArsaP50428 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ArsaP50428 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ArsaP50428 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ArsaP50428 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ArsaP50428 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ArsaP50428 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ArsaP50428 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ArsaP50428 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ArsaP50428 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ArsaP50428 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ArsaP50428 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ArsaP50428 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ArsaP50428 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ArsaP50428 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ArsaP50428 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ArsaP50428 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ArsaP50428 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ArsaP50428 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ArsaP50428 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ArsaP50428 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ArsaP50428 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ArsaP50428 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ArsaP50428 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ArsaP50428 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ArsaP50428 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ArsaP50428 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ArsaP50428 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ArsaP50428 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ArsaP50428 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ArsaP50428 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ArsaP50428 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ArsaP50428 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ArsaP50428 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ArsaP50428 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ArsaP50428 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ArsaP50428 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ArsaP50428 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ArsaP50428 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ArsaP50428 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ArsaP50428 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ArsaP50428 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ArsaP50428 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ArsaP50428 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ArsaP50428 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ArsaP50428 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ArsaP50428 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ArsaP50428 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ArsaP50428 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ArsaP50428 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ArsaP50428 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ArsaP50428 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ArsaP50428 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ArsaP50428 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ArsaP50428 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ArsaP50428 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ArsaP50428 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ArsaP50428 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ArsaP50428 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ArsaP50428 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ArsaP50428 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ArsaP50428 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ArsaP50428 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ArsaP50428 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ArsaP50428 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ArsaP50428 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ArsaP50428 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ArsaP50428 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ArsaP50428 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ArsaP50428 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ArsaP50428 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ArsaP50428 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ArsaP50428 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ArsaP50428 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ArsaP50428 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ArsaP50428 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ArsaP50428 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ArsaP50428 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ArsaP50428 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ArsaP50428 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ArsaP50428 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ArsaP50428 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ArsaP50428 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ArsaP50428 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ArsaP50428 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ArsaP50428 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ArsaP50428 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ArsaP50428 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ArsaP50428 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ArsaP50428 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ArsaP50428 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ArsaP50428 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ArsaP50428 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ArsaP50428 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ArsaP50428 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ArsaP50428 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms