Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SftpdP50404 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SftpdP50404 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SftpdP50404 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SftpdP50404 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SftpdP50404 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SftpdP50404 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SftpdP50404 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SftpdP50404 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SftpdP50404 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SftpdP50404 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SftpdP50404 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SftpdP50404 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SftpdP50404 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SftpdP50404 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SftpdP50404 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SftpdP50404 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SftpdP50404 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SftpdP50404 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SftpdP50404 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SftpdP50404 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SftpdP50404 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SftpdP50404 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SftpdP50404 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SftpdP50404 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SftpdP50404 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SftpdP50404 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SftpdP50404 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SftpdP50404 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SftpdP50404 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SftpdP50404 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SftpdP50404 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SftpdP50404 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SftpdP50404 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SftpdP50404 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SftpdP50404 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SftpdP50404 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SftpdP50404 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SftpdP50404 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SftpdP50404 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SftpdP50404 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SftpdP50404 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SftpdP50404 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SftpdP50404 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SftpdP50404 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SftpdP50404 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SftpdP50404 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SftpdP50404 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SftpdP50404 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SftpdP50404 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SftpdP50404 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SftpdP50404 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SftpdP50404 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SftpdP50404 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SftpdP50404 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SftpdP50404 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SftpdP50404 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SftpdP50404 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SftpdP50404 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SftpdP50404 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SftpdP50404 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SftpdP50404 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SftpdP50404 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SftpdP50404 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SftpdP50404 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SftpdP50404 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SftpdP50404 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SftpdP50404 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SftpdP50404 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SftpdP50404 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SftpdP50404 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SftpdP50404 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SftpdP50404 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SftpdP50404 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SftpdP50404 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SftpdP50404 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SftpdP50404 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SftpdP50404 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SftpdP50404 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SftpdP50404 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SftpdP50404 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SftpdP50404 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SftpdP50404 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SftpdP50404 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SftpdP50404 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SftpdP50404 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SftpdP50404 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SftpdP50404 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SftpdP50404 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SftpdP50404 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SftpdP50404 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SftpdP50404 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SftpdP50404 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SftpdP50404 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SftpdP50404 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SftpdP50404 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SftpdP50404 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SftpdP50404 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SftpdP50404 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SftpdP50404 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms