Protein–RNA interactions for Protein: P50396

Gdi1, Rab GDP dissociation inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdi1P50396 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gdi1P50396 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gdi1P50396 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gdi1P50396 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gdi1P50396 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gdi1P50396 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gdi1P50396 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gdi1P50396 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gdi1P50396 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gdi1P50396 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gdi1P50396 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gdi1P50396 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Gdi1P50396 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gdi1P50396 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gdi1P50396 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gdi1P50396 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gdi1P50396 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gdi1P50396 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gdi1P50396 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gdi1P50396 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gdi1P50396 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gdi1P50396 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gdi1P50396 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gdi1P50396 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gdi1P50396 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gdi1P50396 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gdi1P50396 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gdi1P50396 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gdi1P50396 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gdi1P50396 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gdi1P50396 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gdi1P50396 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gdi1P50396 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gdi1P50396 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gdi1P50396 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gdi1P50396 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gdi1P50396 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gdi1P50396 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gdi1P50396 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gdi1P50396 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gdi1P50396 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms