Protein–RNA interactions for Protein: P50283

Cd7, T-cell antigen CD7, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd7P50283 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd7P50283 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cd7P50283 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd7P50283 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd7P50283 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd7P50283 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd7P50283 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd7P50283 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd7P50283 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd7P50283 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd7P50283 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd7P50283 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd7P50283 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd7P50283 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd7P50283 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd7P50283 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd7P50283 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd7P50283 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd7P50283 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd7P50283 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd7P50283 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd7P50283 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd7P50283 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd7P50283 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd7P50283 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd7P50283 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd7P50283 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd7P50283 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd7P50283 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd7P50283 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd7P50283 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd7P50283 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd7P50283 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd7P50283 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd7P50283 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd7P50283 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd7P50283 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd7P50283 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd7P50283 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd7P50283 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd7P50283 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd7P50283 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd7P50283 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd7P50283 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd7P50283 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd7P50283 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd7P50283 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd7P50283 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd7P50283 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd7P50283 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd7P50283 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd7P50283 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd7P50283 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd7P50283 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd7P50283 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd7P50283 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd7P50283 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd7P50283 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd7P50283 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd7P50283 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd7P50283 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd7P50283 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd7P50283 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd7P50283 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd7P50283 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd7P50283 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd7P50283 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd7P50283 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd7P50283 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd7P50283 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd7P50283 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd7P50283 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd7P50283 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd7P50283 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms