Protein–RNA interactions for Protein: P50220

Nkx2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-1P50220 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkx2-1P50220 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nkx2-1P50220 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms