Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxc13P50207 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxc13P50207 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxc13P50207 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hoxc13P50207 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxc13P50207 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxc13P50207 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxc13P50207 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxc13P50207 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxc13P50207 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxc13P50207 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxc13P50207 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxc13P50207 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxc13P50207 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxc13P50207 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxc13P50207 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxc13P50207 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxc13P50207 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxc13P50207 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxc13P50207 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxc13P50207 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxc13P50207 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxc13P50207 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxc13P50207 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxc13P50207 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxc13P50207 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxc13P50207 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxc13P50207 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxc13P50207 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxc13P50207 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxc13P50207 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxc13P50207 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxc13P50207 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxc13P50207 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxc13P50207 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxc13P50207 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxc13P50207 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxc13P50207 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxc13P50207 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxc13P50207 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxc13P50207 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxc13P50207 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxc13P50207 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxc13P50207 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxc13P50207 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxc13P50207 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxc13P50207 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxc13P50207 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxc13P50207 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxc13P50207 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxc13P50207 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxc13P50207 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxc13P50207 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxc13P50207 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxc13P50207 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxc13P50207 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxc13P50207 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxc13P50207 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxc13P50207 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxc13P50207 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxc13P50207 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxc13P50207 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxc13P50207 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxc13P50207 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxc13P50207 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxc13P50207 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxc13P50207 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxc13P50207 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxc13P50207 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxc13P50207 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxc13P50207 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxc13P50207 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hoxc13P50207 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hoxc13P50207 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxc13P50207 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxc13P50207 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxc13P50207 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxc13P50207 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxc13P50207 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxc13P50207 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxc13P50207 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxc13P50207 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxc13P50207 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxc13P50207 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxc13P50207 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxc13P50207 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxc13P50207 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxc13P50207 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxc13P50207 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxc13P50207 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxc13P50207 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxc13P50207 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxc13P50207 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxc13P50207 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxc13P50207 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxc13P50207 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxc13P50207 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxc13P50207 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxc13P50207 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxc13P50207 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms