Protein–RNA interactions for Protein: P49962

Srp9, Signal recognition particle 9 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp9P49962 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srp9P49962 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srp9P49962 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srp9P49962 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srp9P49962 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srp9P49962 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srp9P49962 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srp9P49962 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srp9P49962 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srp9P49962 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srp9P49962 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srp9P49962 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srp9P49962 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srp9P49962 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srp9P49962 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srp9P49962 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srp9P49962 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srp9P49962 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srp9P49962 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srp9P49962 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srp9P49962 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srp9P49962 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srp9P49962 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srp9P49962 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srp9P49962 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srp9P49962 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srp9P49962 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srp9P49962 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srp9P49962 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srp9P49962 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srp9P49962 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srp9P49962 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srp9P49962 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srp9P49962 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srp9P49962 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srp9P49962 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srp9P49962 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srp9P49962 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srp9P49962 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srp9P49962 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srp9P49962 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srp9P49962 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srp9P49962 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srp9P49962 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srp9P49962 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srp9P49962 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srp9P49962 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srp9P49962 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srp9P49962 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srp9P49962 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srp9P49962 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srp9P49962 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srp9P49962 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srp9P49962 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srp9P49962 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp9P49962 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp9P49962 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp9P49962 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp9P49962 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp9P49962 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp9P49962 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp9P49962 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp9P49962 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp9P49962 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp9P49962 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp9P49962 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp9P49962 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp9P49962 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp9P49962 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp9P49962 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srp9P49962 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srp9P49962 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srp9P49962 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srp9P49962 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srp9P49962 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Srp9P49962 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Srp9P49962 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srp9P49962 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srp9P49962 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srp9P49962 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp9P49962 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp9P49962 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms