Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rbp3P49194 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rbp3P49194 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rbp3P49194 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rbp3P49194 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rbp3P49194 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rbp3P49194 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rbp3P49194 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbp3P49194 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbp3P49194 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbp3P49194 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbp3P49194 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbp3P49194 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbp3P49194 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbp3P49194 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbp3P49194 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbp3P49194 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbp3P49194 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbp3P49194 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbp3P49194 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbp3P49194 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbp3P49194 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbp3P49194 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbp3P49194 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbp3P49194 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbp3P49194 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbp3P49194 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbp3P49194 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbp3P49194 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbp3P49194 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbp3P49194 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbp3P49194 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbp3P49194 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbp3P49194 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbp3P49194 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbp3P49194 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbp3P49194 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbp3P49194 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbp3P49194 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbp3P49194 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbp3P49194 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbp3P49194 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbp3P49194 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbp3P49194 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbp3P49194 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbp3P49194 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbp3P49194 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbp3P49194 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbp3P49194 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbp3P49194 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbp3P49194 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbp3P49194 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbp3P49194 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbp3P49194 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbp3P49194 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbp3P49194 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbp3P49194 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbp3P49194 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbp3P49194 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbp3P49194 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbp3P49194 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbp3P49194 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbp3P49194 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbp3P49194 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rbp3P49194 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rbp3P49194 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rbp3P49194 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Rbp3P49194 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbp3P49194 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rbp3P49194 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbp3P49194 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rbp3P49194 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rbp3P49194 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rbp3P49194 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Rbp3P49194 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbp3P49194 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rbp3P49194 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbp3P49194 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbp3P49194 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rbp3P49194 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rbp3P49194 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rbp3P49194 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rbp3P49194 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Rbp3P49194 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rbp3P49194 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Rbp3P49194 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rbp3P49194 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Rbp3P49194 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rbp3P49194 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rbp3P49194 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rbp3P49194 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rbp3P49194 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rbp3P49194 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rbp3P49194 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rbp3P49194 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rbp3P49194 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rbp3P49194 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rbp3P49194 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rbp3P49194 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rbp3P49194 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms