Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CitP49025 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CitP49025 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CitP49025 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CitP49025 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CitP49025 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CitP49025 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CitP49025 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CitP49025 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CitP49025 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CitP49025 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CitP49025 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CitP49025 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CitP49025 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CitP49025 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CitP49025 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CitP49025 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CitP49025 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CitP49025 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CitP49025 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CitP49025 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CitP49025 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CitP49025 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CitP49025 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CitP49025 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CitP49025 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CitP49025 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CitP49025 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CitP49025 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CitP49025 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CitP49025 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CitP49025 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CitP49025 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CitP49025 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CitP49025 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CitP49025 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CitP49025 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CitP49025 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CitP49025 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CitP49025 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CitP49025 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CitP49025 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CitP49025 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CitP49025 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CitP49025 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CitP49025 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CitP49025 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CitP49025 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CitP49025 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CitP49025 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CitP49025 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CitP49025 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CitP49025 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CitP49025 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CitP49025 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CitP49025 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CitP49025 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CitP49025 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CitP49025 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CitP49025 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CitP49025 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CitP49025 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CitP49025 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CitP49025 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CitP49025 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CitP49025 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CitP49025 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CitP49025 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CitP49025 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CitP49025 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CitP49025 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CitP49025 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CitP49025 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CitP49025 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CitP49025 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CitP49025 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CitP49025 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CitP49025 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CitP49025 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CitP49025 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CitP49025 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CitP49025 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CitP49025 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CitP49025 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CitP49025 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CitP49025 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CitP49025 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CitP49025 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CitP49025 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CitP49025 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CitP49025 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CitP49025 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CitP49025 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CitP49025 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CitP49025 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CitP49025 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CitP49025 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CitP49025 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CitP49025 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CitP49025 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms