Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptx3P48759 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ptx3P48759 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms