Protein–RNA interactions for Protein: P47939

Resp18, Regulated endocrine-specific protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Resp18P47939 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Resp18P47939 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Resp18P47939 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Resp18P47939 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Resp18P47939 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Resp18P47939 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Resp18P47939 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Resp18P47939 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Resp18P47939 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Resp18P47939 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Resp18P47939 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Resp18P47939 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Resp18P47939 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Resp18P47939 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Resp18P47939 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Resp18P47939 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Resp18P47939 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Resp18P47939 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Resp18P47939 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Resp18P47939 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Resp18P47939 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Resp18P47939 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Resp18P47939 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Resp18P47939 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Resp18P47939 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Resp18P47939 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Resp18P47939 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Resp18P47939 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Resp18P47939 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Resp18P47939 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Resp18P47939 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Resp18P47939 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Resp18P47939 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Resp18P47939 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Resp18P47939 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Resp18P47939 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Resp18P47939 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Resp18P47939 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Resp18P47939 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Resp18P47939 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Resp18P47939 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Resp18P47939 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Resp18P47939 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Resp18P47939 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Resp18P47939 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Resp18P47939 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Resp18P47939 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Resp18P47939 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Resp18P47939 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Resp18P47939 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Resp18P47939 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Resp18P47939 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Resp18P47939 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Resp18P47939 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Resp18P47939 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Resp18P47939 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Resp18P47939 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Resp18P47939 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Resp18P47939 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Resp18P47939 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Resp18P47939 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Resp18P47939 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Resp18P47939 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Resp18P47939 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Resp18P47939 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Resp18P47939 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Resp18P47939 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Resp18P47939 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Resp18P47939 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Resp18P47939 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Resp18P47939 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Resp18P47939 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Resp18P47939 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Resp18P47939 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Resp18P47939 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Resp18P47939 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Resp18P47939 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Resp18P47939 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Resp18P47939 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Resp18P47939 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Resp18P47939 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Resp18P47939 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Resp18P47939 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Resp18P47939 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Resp18P47939 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Resp18P47939 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Resp18P47939 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Resp18P47939 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Resp18P47939 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Resp18P47939 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Resp18P47939 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Resp18P47939 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Resp18P47939 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Resp18P47939 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Resp18P47939 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Resp18P47939 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Resp18P47939 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Resp18P47939 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Resp18P47939 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Resp18P47939 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms