Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ItgavP43406 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ItgavP43406 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ItgavP43406 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ItgavP43406 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ItgavP43406 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ItgavP43406 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ItgavP43406 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ItgavP43406 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ItgavP43406 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ItgavP43406 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ItgavP43406 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ItgavP43406 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ItgavP43406 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ItgavP43406 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ItgavP43406 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ItgavP43406 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ItgavP43406 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ItgavP43406 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ItgavP43406 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ItgavP43406 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ItgavP43406 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ItgavP43406 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ItgavP43406 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ItgavP43406 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ItgavP43406 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ItgavP43406 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ItgavP43406 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ItgavP43406 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ItgavP43406 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ItgavP43406 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ItgavP43406 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ItgavP43406 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ItgavP43406 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ItgavP43406 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ItgavP43406 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ItgavP43406 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ItgavP43406 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ItgavP43406 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ItgavP43406 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ItgavP43406 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ItgavP43406 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ItgavP43406 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ItgavP43406 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ItgavP43406 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ItgavP43406 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ItgavP43406 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ItgavP43406 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ItgavP43406 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ItgavP43406 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ItgavP43406 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ItgavP43406 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ItgavP43406 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ItgavP43406 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ItgavP43406 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ItgavP43406 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ItgavP43406 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ItgavP43406 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ItgavP43406 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ItgavP43406 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ItgavP43406 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ItgavP43406 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ItgavP43406 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ItgavP43406 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ItgavP43406 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ItgavP43406 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ItgavP43406 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ItgavP43406 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ItgavP43406 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ItgavP43406 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ItgavP43406 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ItgavP43406 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ItgavP43406 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ItgavP43406 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ItgavP43406 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ItgavP43406 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ItgavP43406 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ItgavP43406 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ItgavP43406 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ItgavP43406 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ItgavP43406 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ItgavP43406 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ItgavP43406 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ItgavP43406 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ItgavP43406 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ItgavP43406 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ItgavP43406 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ItgavP43406 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ItgavP43406 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ItgavP43406 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ItgavP43406 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ItgavP43406 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ItgavP43406 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ItgavP43406 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ItgavP43406 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ItgavP43406 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ItgavP43406 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ItgavP43406 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ItgavP43406 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ItgavP43406 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms