Protein–RNA interactions for Protein: P43300

Egr3, Early growth response protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr3P43300 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Egr3P43300 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Egr3P43300 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Egr3P43300 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Egr3P43300 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Egr3P43300 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Egr3P43300 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Egr3P43300 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Egr3P43300 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Egr3P43300 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Egr3P43300 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Egr3P43300 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Egr3P43300 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Egr3P43300 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Egr3P43300 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Egr3P43300 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Egr3P43300 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Egr3P43300 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Egr3P43300 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Egr3P43300 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Egr3P43300 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Egr3P43300 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Egr3P43300 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Egr3P43300 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Egr3P43300 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Egr3P43300 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Egr3P43300 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Egr3P43300 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Egr3P43300 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Egr3P43300 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Egr3P43300 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Egr3P43300 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Egr3P43300 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Egr3P43300 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Egr3P43300 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Egr3P43300 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Egr3P43300 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Egr3P43300 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Egr3P43300 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Egr3P43300 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Egr3P43300 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Egr3P43300 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Egr3P43300 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Egr3P43300 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Egr3P43300 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Egr3P43300 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Egr3P43300 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Egr3P43300 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Egr3P43300 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Egr3P43300 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Egr3P43300 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Egr3P43300 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Egr3P43300 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Egr3P43300 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Egr3P43300 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Egr3P43300 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Egr3P43300 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Egr3P43300 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Egr3P43300 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Egr3P43300 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms