Protein–RNA interactions for Protein: P41438

Slc19a1, Folate transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc19a1P41438 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc19a1P41438 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc19a1P41438 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc19a1P41438 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc19a1P41438 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc19a1P41438 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc19a1P41438 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc19a1P41438 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc19a1P41438 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc19a1P41438 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc19a1P41438 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc19a1P41438 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc19a1P41438 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc19a1P41438 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc19a1P41438 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc19a1P41438 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc19a1P41438 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc19a1P41438 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc19a1P41438 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc19a1P41438 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc19a1P41438 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc19a1P41438 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc19a1P41438 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc19a1P41438 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc19a1P41438 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc19a1P41438 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc19a1P41438 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc19a1P41438 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc19a1P41438 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc19a1P41438 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc19a1P41438 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc19a1P41438 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc19a1P41438 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc19a1P41438 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc19a1P41438 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc19a1P41438 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc19a1P41438 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc19a1P41438 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc19a1P41438 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc19a1P41438 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc19a1P41438 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc19a1P41438 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc19a1P41438 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc19a1P41438 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc19a1P41438 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc19a1P41438 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc19a1P41438 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc19a1P41438 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc19a1P41438 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc19a1P41438 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc19a1P41438 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc19a1P41438 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc19a1P41438 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc19a1P41438 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc19a1P41438 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc19a1P41438 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc19a1P41438 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc19a1P41438 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc19a1P41438 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc19a1P41438 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc19a1P41438 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc19a1P41438 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc19a1P41438 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc19a1P41438 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc19a1P41438 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc19a1P41438 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc19a1P41438 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc19a1P41438 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc19a1P41438 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc19a1P41438 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc19a1P41438 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc19a1P41438 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc19a1P41438 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc19a1P41438 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc19a1P41438 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc19a1P41438 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc19a1P41438 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc19a1P41438 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc19a1P41438 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc19a1P41438 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc19a1P41438 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc19a1P41438 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc19a1P41438 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc19a1P41438 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Slc19a1P41438 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc19a1P41438 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc19a1P41438 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc19a1P41438 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc19a1P41438 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc19a1P41438 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc19a1P41438 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc19a1P41438 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc19a1P41438 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc19a1P41438 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc19a1P41438 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc19a1P41438 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc19a1P41438 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc19a1P41438 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc19a1P41438 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc19a1P41438 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms