Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LtbP41155 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LtbP41155 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LtbP41155 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LtbP41155 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LtbP41155 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LtbP41155 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LtbP41155 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LtbP41155 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LtbP41155 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LtbP41155 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LtbP41155 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LtbP41155 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LtbP41155 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LtbP41155 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LtbP41155 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LtbP41155 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LtbP41155 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LtbP41155 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LtbP41155 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LtbP41155 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LtbP41155 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LtbP41155 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LtbP41155 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LtbP41155 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LtbP41155 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LtbP41155 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LtbP41155 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LtbP41155 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LtbP41155 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LtbP41155 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LtbP41155 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LtbP41155 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LtbP41155 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LtbP41155 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LtbP41155 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LtbP41155 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LtbP41155 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LtbP41155 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LtbP41155 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LtbP41155 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LtbP41155 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LtbP41155 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LtbP41155 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LtbP41155 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LtbP41155 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LtbP41155 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LtbP41155 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LtbP41155 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LtbP41155 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LtbP41155 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LtbP41155 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LtbP41155 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LtbP41155 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LtbP41155 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LtbP41155 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LtbP41155 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LtbP41155 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LtbP41155 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LtbP41155 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LtbP41155 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LtbP41155 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LtbP41155 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LtbP41155 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LtbP41155 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LtbP41155 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LtbP41155 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LtbP41155 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LtbP41155 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LtbP41155 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LtbP41155 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LtbP41155 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LtbP41155 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LtbP41155 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LtbP41155 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LtbP41155 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LtbP41155 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LtbP41155 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LtbP41155 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LtbP41155 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LtbP41155 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LtbP41155 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LtbP41155 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LtbP41155 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LtbP41155 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LtbP41155 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LtbP41155 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LtbP41155 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LtbP41155 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LtbP41155 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LtbP41155 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LtbP41155 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LtbP41155 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LtbP41155 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LtbP41155 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LtbP41155 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LtbP41155 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LtbP41155 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LtbP41155 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LtbP41155 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms