Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Chd1P40201 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Chd1P40201 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Chd1P40201 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Chd1P40201 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Chd1P40201 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Chd1P40201 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Chd1P40201 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Chd1P40201 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Chd1P40201 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Chd1P40201 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Chd1P40201 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Chd1P40201 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Chd1P40201 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Chd1P40201 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Chd1P40201 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Chd1P40201 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Chd1P40201 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Chd1P40201 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Chd1P40201 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Chd1P40201 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Chd1P40201 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Chd1P40201 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Chd1P40201 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Chd1P40201 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Chd1P40201 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Chd1P40201 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Chd1P40201 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Chd1P40201 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Chd1P40201 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Chd1P40201 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Chd1P40201 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Chd1P40201 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Chd1P40201 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Chd1P40201 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Chd1P40201 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Chd1P40201 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Chd1P40201 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Chd1P40201 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Chd1P40201 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Chd1P40201 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Chd1P40201 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Chd1P40201 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Chd1P40201 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Chd1P40201 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Chd1P40201 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Chd1P40201 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Chd1P40201 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Chd1P40201 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Chd1P40201 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Chd1P40201 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Chd1P40201 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Chd1P40201 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Chd1P40201 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Chd1P40201 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Chd1P40201 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Chd1P40201 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Chd1P40201 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Chd1P40201 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Chd1P40201 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Chd1P40201 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Chd1P40201 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Chd1P40201 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Chd1P40201 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Chd1P40201 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Chd1P40201 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Chd1P40201 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Chd1P40201 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Chd1P40201 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Chd1P40201 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Chd1P40201 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Chd1P40201 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Chd1P40201 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Chd1P40201 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Chd1P40201 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Chd1P40201 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Chd1P40201 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Chd1P40201 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Chd1P40201 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Chd1P40201 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Chd1P40201 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Chd1P40201 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Chd1P40201 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Chd1P40201 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Chd1P40201 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Chd1P40201 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Chd1P40201 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Chd1P40201 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Chd1P40201 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Chd1P40201 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Chd1P40201 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Chd1P40201 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Chd1P40201 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Chd1P40201 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Chd1P40201 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Chd1P40201 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Chd1P40201 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Chd1P40201 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Chd1P40201 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Chd1P40201 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms