Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TtlP38585 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TtlP38585 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TtlP38585 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TtlP38585 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TtlP38585 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TtlP38585 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TtlP38585 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TtlP38585 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TtlP38585 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TtlP38585 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TtlP38585 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TtlP38585 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TtlP38585 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TtlP38585 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TtlP38585 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TtlP38585 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TtlP38585 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TtlP38585 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TtlP38585 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TtlP38585 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TtlP38585 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TtlP38585 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TtlP38585 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TtlP38585 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TtlP38585 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TtlP38585 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TtlP38585 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TtlP38585 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TtlP38585 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TtlP38585 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TtlP38585 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TtlP38585 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TtlP38585 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TtlP38585 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TtlP38585 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TtlP38585 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TtlP38585 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TtlP38585 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TtlP38585 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TtlP38585 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TtlP38585 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TtlP38585 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TtlP38585 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TtlP38585 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TtlP38585 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TtlP38585 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TtlP38585 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TtlP38585 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TtlP38585 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TtlP38585 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TtlP38585 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TtlP38585 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TtlP38585 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TtlP38585 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TtlP38585 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TtlP38585 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TtlP38585 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TtlP38585 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TtlP38585 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TtlP38585 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TtlP38585 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TtlP38585 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TtlP38585 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TtlP38585 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TtlP38585 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TtlP38585 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TtlP38585 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TtlP38585 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TtlP38585 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TtlP38585 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TtlP38585 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TtlP38585 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TtlP38585 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TtlP38585 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TtlP38585 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TtlP38585 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TtlP38585 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TtlP38585 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TtlP38585 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TtlP38585 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
TtlP38585 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TtlP38585 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TtlP38585 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TtlP38585 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TtlP38585 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TtlP38585 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TtlP38585 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TtlP38585 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TtlP38585 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TtlP38585 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TtlP38585 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TtlP38585 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TtlP38585 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TtlP38585 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TtlP38585 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TtlP38585 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TtlP38585 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TtlP38585 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TtlP38585 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms