Protein–RNA interactions for Protein: P35689

Ercc5, DNA repair protein complementing XP-G cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc5P35689 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Ercc5P35689 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ercc5P35689 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ercc5P35689 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ercc5P35689 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ercc5P35689 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ercc5P35689 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ercc5P35689 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ercc5P35689 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms