Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rfc1P35601 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rfc1P35601 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rfc1P35601 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rfc1P35601 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rfc1P35601 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rfc1P35601 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rfc1P35601 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rfc1P35601 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rfc1P35601 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rfc1P35601 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rfc1P35601 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rfc1P35601 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rfc1P35601 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rfc1P35601 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rfc1P35601 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rfc1P35601 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rfc1P35601 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rfc1P35601 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rfc1P35601 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rfc1P35601 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rfc1P35601 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rfc1P35601 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rfc1P35601 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rfc1P35601 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rfc1P35601 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rfc1P35601 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rfc1P35601 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rfc1P35601 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rfc1P35601 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rfc1P35601 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rfc1P35601 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rfc1P35601 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rfc1P35601 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rfc1P35601 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rfc1P35601 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rfc1P35601 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rfc1P35601 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rfc1P35601 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rfc1P35601 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rfc1P35601 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rfc1P35601 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rfc1P35601 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rfc1P35601 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rfc1P35601 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rfc1P35601 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rfc1P35601 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rfc1P35601 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rfc1P35601 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rfc1P35601 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rfc1P35601 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rfc1P35601 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rfc1P35601 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rfc1P35601 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rfc1P35601 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rfc1P35601 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rfc1P35601 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rfc1P35601 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rfc1P35601 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rfc1P35601 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rfc1P35601 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rfc1P35601 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rfc1P35601 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rfc1P35601 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rfc1P35601 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rfc1P35601 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rfc1P35601 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rfc1P35601 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rfc1P35601 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rfc1P35601 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rfc1P35601 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rfc1P35601 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rfc1P35601 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rfc1P35601 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rfc1P35601 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rfc1P35601 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rfc1P35601 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rfc1P35601 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rfc1P35601 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rfc1P35601 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rfc1P35601 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rfc1P35601 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rfc1P35601 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rfc1P35601 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rfc1P35601 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rfc1P35601 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rfc1P35601 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rfc1P35601 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rfc1P35601 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rfc1P35601 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rfc1P35601 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rfc1P35601 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rfc1P35601 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rfc1P35601 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rfc1P35601 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rfc1P35601 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rfc1P35601 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rfc1P35601 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rfc1P35601 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rfc1P35601 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms