Protein–RNA interactions for Protein: P35329

Cd22, B-cell receptor CD22, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd22P35329 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd22P35329 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd22P35329 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd22P35329 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd22P35329 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd22P35329 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cd22P35329 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cd22P35329 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd22P35329 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd22P35329 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd22P35329 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd22P35329 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd22P35329 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd22P35329 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd22P35329 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd22P35329 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd22P35329 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd22P35329 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd22P35329 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd22P35329 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cd22P35329 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd22P35329 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd22P35329 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd22P35329 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd22P35329 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd22P35329 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd22P35329 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd22P35329 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd22P35329 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cd22P35329 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd22P35329 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd22P35329 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd22P35329 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd22P35329 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd22P35329 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd22P35329 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd22P35329 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd22P35329 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd22P35329 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cd22P35329 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd22P35329 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd22P35329 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd22P35329 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd22P35329 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd22P35329 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd22P35329 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd22P35329 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cd22P35329 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd22P35329 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd22P35329 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd22P35329 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd22P35329 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd22P35329 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd22P35329 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cd22P35329 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd22P35329 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd22P35329 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd22P35329 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd22P35329 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd22P35329 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd22P35329 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd22P35329 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd22P35329 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd22P35329 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd22P35329 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd22P35329 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd22P35329 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd22P35329 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd22P35329 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd22P35329 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd22P35329 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd22P35329 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cd22P35329 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cd22P35329 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd22P35329 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd22P35329 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd22P35329 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd22P35329 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd22P35329 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd22P35329 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd22P35329 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd22P35329 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd22P35329 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd22P35329 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd22P35329 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd22P35329 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cd22P35329 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cd22P35329 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cd22P35329 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cd22P35329 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cd22P35329 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cd22P35329 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cd22P35329 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cd22P35329 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cd22P35329 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cd22P35329 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cd22P35329 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cd22P35329 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cd22P35329 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cd22P35329 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms