Protein–RNA interactions for Protein: P33611

Pola2, DNA polymerase alpha subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola2P33611 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pola2P33611 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pola2P33611 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pola2P33611 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pola2P33611 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pola2P33611 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pola2P33611 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pola2P33611 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pola2P33611 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pola2P33611 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pola2P33611 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pola2P33611 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pola2P33611 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pola2P33611 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pola2P33611 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pola2P33611 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pola2P33611 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pola2P33611 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pola2P33611 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pola2P33611 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pola2P33611 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pola2P33611 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pola2P33611 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pola2P33611 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pola2P33611 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pola2P33611 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pola2P33611 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pola2P33611 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pola2P33611 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Pola2P33611 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pola2P33611 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pola2P33611 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Pola2P33611 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pola2P33611 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pola2P33611 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pola2P33611 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pola2P33611 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pola2P33611 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pola2P33611 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pola2P33611 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pola2P33611 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pola2P33611 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pola2P33611 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pola2P33611 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Pola2P33611 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pola2P33611 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pola2P33611 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pola2P33611 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pola2P33611 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pola2P33611 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pola2P33611 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pola2P33611 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pola2P33611 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pola2P33611 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pola2P33611 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pola2P33611 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Pola2P33611 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pola2P33611 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pola2P33611 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pola2P33611 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pola2P33611 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pola2P33611 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pola2P33611 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pola2P33611 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pola2P33611 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pola2P33611 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pola2P33611 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pola2P33611 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pola2P33611 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pola2P33611 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pola2P33611 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pola2P33611 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pola2P33611 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pola2P33611 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Pola2P33611 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pola2P33611 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pola2P33611 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pola2P33611 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pola2P33611 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pola2P33611 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pola2P33611 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pola2P33611 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pola2P33611 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pola2P33611 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pola2P33611 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Pola2P33611 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Pola2P33611 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pola2P33611 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pola2P33611 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pola2P33611 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pola2P33611 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pola2P33611 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pola2P33611 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pola2P33611 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pola2P33611 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pola2P33611 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pola2P33611 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pola2P33611 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pola2P33611 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pola2P33611 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms