Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Pola1P33609 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pola1P33609 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pola1P33609 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pola1P33609 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pola1P33609 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pola1P33609 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pola1P33609 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Pola1P33609 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pola1P33609 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pola1P33609 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pola1P33609 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pola1P33609 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pola1P33609 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pola1P33609 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pola1P33609 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pola1P33609 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pola1P33609 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pola1P33609 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pola1P33609 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pola1P33609 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pola1P33609 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pola1P33609 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pola1P33609 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pola1P33609 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pola1P33609 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Pola1P33609 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Pola1P33609 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Pola1P33609 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Pola1P33609 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Pola1P33609 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pola1P33609 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pola1P33609 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Pola1P33609 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pola1P33609 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pola1P33609 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pola1P33609 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pola1P33609 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Pola1P33609 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pola1P33609 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pola1P33609 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pola1P33609 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pola1P33609 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pola1P33609 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pola1P33609 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pola1P33609 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pola1P33609 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Pola1P33609 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pola1P33609 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pola1P33609 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pola1P33609 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pola1P33609 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pola1P33609 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Pola1P33609 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pola1P33609 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pola1P33609 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pola1P33609 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pola1P33609 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pola1P33609 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pola1P33609 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pola1P33609 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pola1P33609 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pola1P33609 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pola1P33609 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pola1P33609 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pola1P33609 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pola1P33609 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pola1P33609 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pola1P33609 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pola1P33609 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pola1P33609 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pola1P33609 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pola1P33609 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pola1P33609 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pola1P33609 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pola1P33609 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pola1P33609 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pola1P33609 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pola1P33609 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pola1P33609 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pola1P33609 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pola1P33609 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pola1P33609 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pola1P33609 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pola1P33609 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pola1P33609 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pola1P33609 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pola1P33609 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pola1P33609 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pola1P33609 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pola1P33609 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pola1P33609 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pola1P33609 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pola1P33609 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pola1P33609 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pola1P33609 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pola1P33609 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pola1P33609 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pola1P33609 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pola1P33609 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms