Protein–RNA interactions for Protein: P33146

Cdh15, Cadherin-15, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh15P33146 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdh15P33146 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdh15P33146 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdh15P33146 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdh15P33146 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdh15P33146 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdh15P33146 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdh15P33146 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdh15P33146 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdh15P33146 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdh15P33146 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdh15P33146 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdh15P33146 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdh15P33146 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdh15P33146 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdh15P33146 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdh15P33146 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdh15P33146 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdh15P33146 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdh15P33146 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdh15P33146 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdh15P33146 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdh15P33146 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms