Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ctnnd1P30999 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Ctnnd1P30999 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ctnnd1P30999 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ctnnd1P30999 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ctnnd1P30999 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ctnnd1P30999 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ctnnd1P30999 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctnnd1P30999 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctnnd1P30999 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctnnd1P30999 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctnnd1P30999 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctnnd1P30999 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctnnd1P30999 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctnnd1P30999 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctnnd1P30999 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctnnd1P30999 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctnnd1P30999 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ctnnd1P30999 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ctnnd1P30999 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ctnnd1P30999 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ctnnd1P30999 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ctnnd1P30999 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ctnnd1P30999 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ctnnd1P30999 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ctnnd1P30999 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ctnnd1P30999 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctnnd1P30999 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctnnd1P30999 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctnnd1P30999 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctnnd1P30999 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctnnd1P30999 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctnnd1P30999 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctnnd1P30999 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctnnd1P30999 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctnnd1P30999 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctnnd1P30999 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctnnd1P30999 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctnnd1P30999 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctnnd1P30999 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctnnd1P30999 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctnnd1P30999 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctnnd1P30999 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctnnd1P30999 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctnnd1P30999 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctnnd1P30999 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctnnd1P30999 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctnnd1P30999 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctnnd1P30999 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctnnd1P30999 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctnnd1P30999 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctnnd1P30999 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctnnd1P30999 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctnnd1P30999 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctnnd1P30999 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctnnd1P30999 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctnnd1P30999 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctnnd1P30999 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctnnd1P30999 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctnnd1P30999 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnnd1P30999 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnnd1P30999 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnnd1P30999 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnnd1P30999 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnnd1P30999 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnnd1P30999 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnnd1P30999 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnnd1P30999 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnnd1P30999 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnnd1P30999 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctnnd1P30999 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctnnd1P30999 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctnnd1P30999 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctnnd1P30999 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctnnd1P30999 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctnnd1P30999 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctnnd1P30999 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctnnd1P30999 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ctnnd1P30999 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ctnnd1P30999 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ctnnd1P30999 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ctnnd1P30999 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ctnnd1P30999 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ctnnd1P30999 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ctnnd1P30999 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ctnnd1P30999 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ctnnd1P30999 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ctnnd1P30999 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ctnnd1P30999 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ctnnd1P30999 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ctnnd1P30999 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ctnnd1P30999 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctnnd1P30999 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctnnd1P30999 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctnnd1P30999 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctnnd1P30999 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctnnd1P30999 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctnnd1P30999 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctnnd1P30999 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctnnd1P30999 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms