Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VtnP29788 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VtnP29788 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
VtnP29788 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VtnP29788 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VtnP29788 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VtnP29788 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VtnP29788 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VtnP29788 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VtnP29788 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VtnP29788 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VtnP29788 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VtnP29788 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VtnP29788 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VtnP29788 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VtnP29788 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VtnP29788 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VtnP29788 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VtnP29788 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VtnP29788 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VtnP29788 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VtnP29788 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
VtnP29788 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VtnP29788 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VtnP29788 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VtnP29788 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VtnP29788 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VtnP29788 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VtnP29788 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VtnP29788 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VtnP29788 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VtnP29788 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VtnP29788 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VtnP29788 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VtnP29788 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VtnP29788 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VtnP29788 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VtnP29788 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VtnP29788 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VtnP29788 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VtnP29788 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VtnP29788 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
VtnP29788 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VtnP29788 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VtnP29788 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VtnP29788 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VtnP29788 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VtnP29788 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VtnP29788 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VtnP29788 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VtnP29788 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VtnP29788 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VtnP29788 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VtnP29788 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VtnP29788 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VtnP29788 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VtnP29788 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VtnP29788 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VtnP29788 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VtnP29788 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VtnP29788 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VtnP29788 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VtnP29788 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VtnP29788 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VtnP29788 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VtnP29788 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VtnP29788 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VtnP29788 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VtnP29788 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VtnP29788 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VtnP29788 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VtnP29788 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VtnP29788 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VtnP29788 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VtnP29788 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VtnP29788 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VtnP29788 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VtnP29788 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VtnP29788 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VtnP29788 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VtnP29788 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VtnP29788 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VtnP29788 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VtnP29788 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VtnP29788 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VtnP29788 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VtnP29788 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VtnP29788 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VtnP29788 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VtnP29788 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VtnP29788 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VtnP29788 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
VtnP29788 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VtnP29788 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VtnP29788 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VtnP29788 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VtnP29788 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VtnP29788 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VtnP29788 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VtnP29788 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms