Protein–RNA interactions for Protein: P29533

Vcam1, Vascular cell adhesion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcam1P29533 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vcam1P29533 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vcam1P29533 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vcam1P29533 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vcam1P29533 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vcam1P29533 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vcam1P29533 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vcam1P29533 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vcam1P29533 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vcam1P29533 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vcam1P29533 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vcam1P29533 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Vcam1P29533 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vcam1P29533 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vcam1P29533 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vcam1P29533 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Vcam1P29533 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vcam1P29533 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vcam1P29533 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vcam1P29533 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Vcam1P29533 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Vcam1P29533 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vcam1P29533 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vcam1P29533 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vcam1P29533 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vcam1P29533 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vcam1P29533 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vcam1P29533 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vcam1P29533 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vcam1P29533 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vcam1P29533 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vcam1P29533 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vcam1P29533 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vcam1P29533 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vcam1P29533 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vcam1P29533 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vcam1P29533 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vcam1P29533 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Vcam1P29533 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vcam1P29533 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vcam1P29533 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vcam1P29533 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vcam1P29533 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vcam1P29533 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vcam1P29533 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vcam1P29533 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vcam1P29533 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vcam1P29533 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Vcam1P29533 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vcam1P29533 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vcam1P29533 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vcam1P29533 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vcam1P29533 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vcam1P29533 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vcam1P29533 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vcam1P29533 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vcam1P29533 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vcam1P29533 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vcam1P29533 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vcam1P29533 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vcam1P29533 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vcam1P29533 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vcam1P29533 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vcam1P29533 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vcam1P29533 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vcam1P29533 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vcam1P29533 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vcam1P29533 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vcam1P29533 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vcam1P29533 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vcam1P29533 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vcam1P29533 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vcam1P29533 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vcam1P29533 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vcam1P29533 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Vcam1P29533 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Vcam1P29533 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vcam1P29533 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vcam1P29533 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vcam1P29533 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vcam1P29533 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vcam1P29533 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vcam1P29533 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vcam1P29533 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vcam1P29533 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vcam1P29533 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vcam1P29533 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vcam1P29533 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vcam1P29533 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vcam1P29533 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vcam1P29533 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Vcam1P29533 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Vcam1P29533 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vcam1P29533 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vcam1P29533 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vcam1P29533 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vcam1P29533 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vcam1P29533 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vcam1P29533 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vcam1P29533 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms