Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BgnP28653 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BgnP28653 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BgnP28653 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BgnP28653 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BgnP28653 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BgnP28653 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BgnP28653 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BgnP28653 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BgnP28653 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BgnP28653 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BgnP28653 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BgnP28653 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BgnP28653 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BgnP28653 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BgnP28653 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BgnP28653 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BgnP28653 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BgnP28653 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BgnP28653 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BgnP28653 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BgnP28653 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BgnP28653 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BgnP28653 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BgnP28653 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BgnP28653 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BgnP28653 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BgnP28653 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BgnP28653 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BgnP28653 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BgnP28653 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BgnP28653 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BgnP28653 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BgnP28653 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BgnP28653 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BgnP28653 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BgnP28653 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BgnP28653 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BgnP28653 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BgnP28653 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BgnP28653 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BgnP28653 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BgnP28653 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BgnP28653 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BgnP28653 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BgnP28653 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BgnP28653 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BgnP28653 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BgnP28653 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BgnP28653 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BgnP28653 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BgnP28653 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BgnP28653 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BgnP28653 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
BgnP28653 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BgnP28653 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BgnP28653 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BgnP28653 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BgnP28653 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BgnP28653 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BgnP28653 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BgnP28653 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BgnP28653 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BgnP28653 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BgnP28653 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BgnP28653 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BgnP28653 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BgnP28653 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
BgnP28653 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BgnP28653 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BgnP28653 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BgnP28653 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BgnP28653 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BgnP28653 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BgnP28653 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BgnP28653 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BgnP28653 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BgnP28653 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BgnP28653 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BgnP28653 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BgnP28653 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BgnP28653 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BgnP28653 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BgnP28653 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BgnP28653 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BgnP28653 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BgnP28653 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BgnP28653 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BgnP28653 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BgnP28653 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BgnP28653 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BgnP28653 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BgnP28653 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BgnP28653 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BgnP28653 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BgnP28653 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BgnP28653 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BgnP28653 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BgnP28653 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BgnP28653 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms