Protein–RNA interactions for Protein: P28033

Cebpb, CCAAT/enhancer-binding protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpbP28033 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CebpbP28033 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CebpbP28033 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CebpbP28033 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CebpbP28033 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CebpbP28033 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CebpbP28033 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CebpbP28033 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CebpbP28033 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CebpbP28033 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CebpbP28033 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CebpbP28033 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CebpbP28033 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CebpbP28033 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CebpbP28033 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CebpbP28033 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CebpbP28033 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CebpbP28033 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CebpbP28033 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CebpbP28033 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CebpbP28033 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CebpbP28033 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CebpbP28033 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CebpbP28033 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CebpbP28033 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CebpbP28033 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CebpbP28033 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CebpbP28033 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CebpbP28033 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CebpbP28033 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CebpbP28033 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CebpbP28033 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CebpbP28033 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CebpbP28033 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CebpbP28033 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CebpbP28033 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CebpbP28033 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CebpbP28033 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CebpbP28033 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CebpbP28033 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CebpbP28033 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CebpbP28033 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CebpbP28033 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CebpbP28033 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CebpbP28033 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CebpbP28033 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CebpbP28033 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CebpbP28033 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CebpbP28033 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CebpbP28033 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CebpbP28033 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CebpbP28033 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CebpbP28033 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CebpbP28033 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CebpbP28033 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CebpbP28033 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CebpbP28033 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CebpbP28033 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CebpbP28033 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CebpbP28033 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CebpbP28033 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CebpbP28033 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CebpbP28033 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CebpbP28033 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CebpbP28033 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CebpbP28033 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CebpbP28033 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CebpbP28033 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CebpbP28033 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CebpbP28033 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CebpbP28033 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CebpbP28033 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CebpbP28033 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CebpbP28033 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CebpbP28033 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CebpbP28033 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CebpbP28033 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CebpbP28033 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CebpbP28033 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CebpbP28033 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CebpbP28033 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CebpbP28033 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CebpbP28033 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CebpbP28033 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CebpbP28033 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CebpbP28033 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CebpbP28033 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CebpbP28033 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CebpbP28033 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CebpbP28033 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CebpbP28033 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CebpbP28033 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CebpbP28033 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CebpbP28033 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CebpbP28033 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CebpbP28033 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CebpbP28033 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CebpbP28033 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CebpbP28033 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CebpbP28033 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms