Protein–RNA interactions for Protein: P27548

Cd40lg, CD40 ligand, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd40lgP27548 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cd40lgP27548 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd40lgP27548 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd40lgP27548 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd40lgP27548 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd40lgP27548 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd40lgP27548 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd40lgP27548 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd40lgP27548 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd40lgP27548 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd40lgP27548 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd40lgP27548 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd40lgP27548 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd40lgP27548 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd40lgP27548 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd40lgP27548 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms