Protein–RNA interactions for Protein: P25425

Pou2f1, POU domain, class 2, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f1P25425 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pou2f1P25425 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou2f1P25425 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms