Protein–RNA interactions for Protein: P23906

Irf2, Interferon regulatory factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf2P23906 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irf2P23906 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irf2P23906 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Irf2P23906 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irf2P23906 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irf2P23906 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Irf2P23906 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irf2P23906 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irf2P23906 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irf2P23906 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irf2P23906 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irf2P23906 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irf2P23906 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irf2P23906 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irf2P23906 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irf2P23906 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irf2P23906 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irf2P23906 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irf2P23906 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irf2P23906 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irf2P23906 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irf2P23906 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf2P23906 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf2P23906 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf2P23906 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf2P23906 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf2P23906 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf2P23906 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf2P23906 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf2P23906 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf2P23906 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf2P23906 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf2P23906 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irf2P23906 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irf2P23906 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irf2P23906 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irf2P23906 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irf2P23906 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irf2P23906 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irf2P23906 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irf2P23906 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irf2P23906 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irf2P23906 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irf2P23906 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irf2P23906 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irf2P23906 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irf2P23906 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irf2P23906 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irf2P23906 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Irf2P23906 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irf2P23906 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irf2P23906 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irf2P23906 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irf2P23906 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irf2P23906 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irf2P23906 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irf2P23906 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irf2P23906 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irf2P23906 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irf2P23906 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irf2P23906 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irf2P23906 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irf2P23906 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irf2P23906 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irf2P23906 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irf2P23906 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Irf2P23906 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irf2P23906 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irf2P23906 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irf2P23906 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irf2P23906 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irf2P23906 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irf2P23906 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irf2P23906 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irf2P23906 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irf2P23906 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irf2P23906 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irf2P23906 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irf2P23906 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irf2P23906 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irf2P23906 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irf2P23906 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irf2P23906 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irf2P23906 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irf2P23906 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irf2P23906 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irf2P23906 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irf2P23906 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Irf2P23906 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irf2P23906 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irf2P23906 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irf2P23906 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irf2P23906 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irf2P23906 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Irf2P23906 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irf2P23906 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irf2P23906 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irf2P23906 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irf2P23906 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irf2P23906 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms