Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clk1P22518 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clk1P22518 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clk1P22518 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clk1P22518 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clk1P22518 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clk1P22518 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Clk1P22518 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clk1P22518 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Clk1P22518 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clk1P22518 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clk1P22518 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clk1P22518 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clk1P22518 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clk1P22518 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clk1P22518 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clk1P22518 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Clk1P22518 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clk1P22518 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clk1P22518 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clk1P22518 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clk1P22518 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clk1P22518 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clk1P22518 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clk1P22518 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clk1P22518 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clk1P22518 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clk1P22518 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Clk1P22518 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Clk1P22518 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clk1P22518 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clk1P22518 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clk1P22518 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clk1P22518 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clk1P22518 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clk1P22518 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clk1P22518 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clk1P22518 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Clk1P22518 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clk1P22518 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clk1P22518 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clk1P22518 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clk1P22518 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clk1P22518 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clk1P22518 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clk1P22518 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clk1P22518 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clk1P22518 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clk1P22518 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clk1P22518 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clk1P22518 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clk1P22518 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clk1P22518 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clk1P22518 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clk1P22518 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clk1P22518 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Clk1P22518 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Clk1P22518 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Clk1P22518 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clk1P22518 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clk1P22518 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clk1P22518 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clk1P22518 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clk1P22518 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clk1P22518 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clk1P22518 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clk1P22518 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clk1P22518 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Clk1P22518 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clk1P22518 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Clk1P22518 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Clk1P22518 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clk1P22518 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clk1P22518 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clk1P22518 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clk1P22518 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clk1P22518 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clk1P22518 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clk1P22518 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clk1P22518 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clk1P22518 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clk1P22518 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clk1P22518 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clk1P22518 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clk1P22518 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Clk1P22518 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clk1P22518 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clk1P22518 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clk1P22518 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Clk1P22518 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Clk1P22518 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clk1P22518 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clk1P22518 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clk1P22518 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clk1P22518 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clk1P22518 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clk1P22518 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clk1P22518 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clk1P22518 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clk1P22518 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms