Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pou3f1P21952 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pou3f1P21952 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pou3f1P21952 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms