Protein–RNA interactions for Protein: P21237

Bdnf, Brain-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BdnfP21237 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BdnfP21237 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BdnfP21237 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BdnfP21237 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BdnfP21237 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BdnfP21237 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BdnfP21237 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BdnfP21237 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BdnfP21237 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BdnfP21237 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BdnfP21237 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BdnfP21237 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BdnfP21237 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BdnfP21237 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BdnfP21237 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BdnfP21237 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms