Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PrkcaP20444 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PrkcaP20444 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PrkcaP20444 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrkcaP20444 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrkcaP20444 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrkcaP20444 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrkcaP20444 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PrkcaP20444 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrkcaP20444 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrkcaP20444 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrkcaP20444 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PrkcaP20444 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PrkcaP20444 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PrkcaP20444 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PrkcaP20444 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PrkcaP20444 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PrkcaP20444 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PrkcaP20444 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PrkcaP20444 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PrkcaP20444 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PrkcaP20444 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PrkcaP20444 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PrkcaP20444 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PrkcaP20444 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PrkcaP20444 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PrkcaP20444 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PrkcaP20444 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PrkcaP20444 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PrkcaP20444 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PrkcaP20444 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PrkcaP20444 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PrkcaP20444 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PrkcaP20444 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PrkcaP20444 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PrkcaP20444 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PrkcaP20444 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms