Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TP20293 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TP20293 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TP20293 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TP20293 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TP20293 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TP20293 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TP20293 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TP20293 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TP20293 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TP20293 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TP20293 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TP20293 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TP20293 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TP20293 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TP20293 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TP20293 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TP20293 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TP20293 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TP20293 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TP20293 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TP20293 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TP20293 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TP20293 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TP20293 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TP20293 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TP20293 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TP20293 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TP20293 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TP20293 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TP20293 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TP20293 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TP20293 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TP20293 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TP20293 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TP20293 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
TP20293 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TP20293 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TP20293 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TP20293 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TP20293 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TP20293 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TP20293 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TP20293 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TP20293 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TP20293 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TP20293 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TP20293 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TP20293 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TP20293 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TP20293 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TP20293 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TP20293 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TP20293 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TP20293 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TP20293 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TP20293 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TP20293 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TP20293 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TP20293 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TP20293 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TP20293 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TP20293 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TP20293 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TP20293 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TP20293 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TP20293 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TP20293 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TP20293 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TP20293 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TP20293 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TP20293 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TP20293 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TP20293 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TP20293 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TP20293 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TP20293 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TP20293 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TP20293 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TP20293 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TP20293 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TP20293 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TP20293 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TP20293 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TP20293 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TP20293 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TP20293 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TP20293 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TP20293 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TP20293 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TP20293 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TP20293 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TP20293 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TP20293 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TP20293 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TP20293 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TP20293 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TP20293 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TP20293 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TP20293 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms