Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VimP20152 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VimP20152 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VimP20152 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VimP20152 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VimP20152 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VimP20152 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VimP20152 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VimP20152 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VimP20152 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VimP20152 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VimP20152 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VimP20152 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VimP20152 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VimP20152 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VimP20152 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VimP20152 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VimP20152 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VimP20152 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VimP20152 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VimP20152 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VimP20152 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VimP20152 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VimP20152 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VimP20152 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VimP20152 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VimP20152 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VimP20152 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VimP20152 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
VimP20152 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VimP20152 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
VimP20152 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VimP20152 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VimP20152 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VimP20152 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VimP20152 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VimP20152 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VimP20152 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VimP20152 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VimP20152 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VimP20152 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
VimP20152 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
VimP20152 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
VimP20152 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VimP20152 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VimP20152 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VimP20152 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VimP20152 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
VimP20152 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VimP20152 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VimP20152 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VimP20152 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VimP20152 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VimP20152 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VimP20152 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
VimP20152 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VimP20152 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VimP20152 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VimP20152 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
VimP20152 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VimP20152 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VimP20152 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VimP20152 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VimP20152 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VimP20152 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VimP20152 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VimP20152 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VimP20152 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VimP20152 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VimP20152 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VimP20152 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VimP20152 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VimP20152 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VimP20152 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VimP20152 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VimP20152 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VimP20152 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VimP20152 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VimP20152 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VimP20152 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VimP20152 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VimP20152 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VimP20152 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VimP20152 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VimP20152 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VimP20152 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VimP20152 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VimP20152 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VimP20152 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VimP20152 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VimP20152 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VimP20152 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VimP20152 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VimP20152 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VimP20152 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VimP20152 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VimP20152 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VimP20152 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VimP20152 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VimP20152 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms