Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P20040 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P20040 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P20040 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P20040 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P20040 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P20040 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P20040 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P20040 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P20040 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P20040 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P20040 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P20040 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P20040 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P20040 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P20040 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
P20040 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P20040 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P20040 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P20040 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P20040 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P20040 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P20040 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P20040 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P20040 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P20040 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P20040 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P20040 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P20040 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
P20040 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
P20040 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
P20040 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P20040 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
P20040 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P20040 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P20040 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P20040 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P20040 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
P20040 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
P20040 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
P20040 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P20040 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
P20040 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P20040 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
P20040 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
P20040 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
P20040 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P20040 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P20040 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
P20040 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P20040 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
P20040 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P20040 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P20040 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P20040 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P20040 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
P20040 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
P20040 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
P20040 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P20040 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
P20040 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
P20040 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P20040 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P20040 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P20040 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P20040 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P20040 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P20040 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P20040 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P20040 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
P20040 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
P20040 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P20040 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P20040 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P20040 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P20040 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P20040 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
P20040 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
P20040 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
P20040 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P20040 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
P20040 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
P20040 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P20040 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P20040 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P20040 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P20040 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
P20040 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
P20040 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P20040 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P20040 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P20040 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
P20040 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
P20040 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P20040 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P20040 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P20040 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
P20040 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
P20040 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P20040 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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