Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NefhP19246 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NefhP19246 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NefhP19246 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NefhP19246 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NefhP19246 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NefhP19246 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NefhP19246 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NefhP19246 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NefhP19246 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NefhP19246 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NefhP19246 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NefhP19246 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NefhP19246 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NefhP19246 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NefhP19246 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NefhP19246 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NefhP19246 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NefhP19246 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NefhP19246 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NefhP19246 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NefhP19246 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NefhP19246 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NefhP19246 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NefhP19246 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NefhP19246 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NefhP19246 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NefhP19246 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NefhP19246 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NefhP19246 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NefhP19246 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NefhP19246 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NefhP19246 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NefhP19246 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NefhP19246 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NefhP19246 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NefhP19246 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NefhP19246 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NefhP19246 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NefhP19246 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NefhP19246 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NefhP19246 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NefhP19246 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NefhP19246 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NefhP19246 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NefhP19246 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NefhP19246 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NefhP19246 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NefhP19246 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NefhP19246 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NefhP19246 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NefhP19246 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NefhP19246 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NefhP19246 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NefhP19246 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NefhP19246 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NefhP19246 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NefhP19246 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NefhP19246 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NefhP19246 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NefhP19246 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NefhP19246 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NefhP19246 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NefhP19246 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NefhP19246 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NefhP19246 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NefhP19246 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NefhP19246 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NefhP19246 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NefhP19246 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NefhP19246 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NefhP19246 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NefhP19246 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NefhP19246 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NefhP19246 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NefhP19246 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NefhP19246 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NefhP19246 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NefhP19246 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NefhP19246 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NefhP19246 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NefhP19246 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NefhP19246 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NefhP19246 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NefhP19246 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NefhP19246 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NefhP19246 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NefhP19246 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NefhP19246 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NefhP19246 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NefhP19246 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NefhP19246 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NefhP19246 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NefhP19246 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NefhP19246 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NefhP19246 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NefhP19246 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NefhP19246 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NefhP19246 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NefhP19246 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms