Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RargP18911 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RargP18911 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RargP18911 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RargP18911 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RargP18911 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RargP18911 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RargP18911 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RargP18911 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RargP18911 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RargP18911 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RargP18911 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RargP18911 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RargP18911 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RargP18911 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RargP18911 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RargP18911 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RargP18911 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RargP18911 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RargP18911 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RargP18911 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RargP18911 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RargP18911 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RargP18911 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RargP18911 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RargP18911 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RargP18911 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RargP18911 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RargP18911 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RargP18911 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RargP18911 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RargP18911 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RargP18911 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RargP18911 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RargP18911 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RargP18911 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RargP18911 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RargP18911 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RargP18911 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RargP18911 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RargP18911 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RargP18911 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RargP18911 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RargP18911 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RargP18911 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RargP18911 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RargP18911 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RargP18911 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RargP18911 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RargP18911 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RargP18911 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RargP18911 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RargP18911 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RargP18911 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RargP18911 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RargP18911 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RargP18911 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RargP18911 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RargP18911 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RargP18911 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RargP18911 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RargP18911 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RargP18911 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RargP18911 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RargP18911 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RargP18911 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RargP18911 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RargP18911 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RargP18911 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RargP18911 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RargP18911 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RargP18911 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RargP18911 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RargP18911 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RargP18911 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RargP18911 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RargP18911 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RargP18911 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RargP18911 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RargP18911 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RargP18911 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RargP18911 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RargP18911 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RargP18911 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RargP18911 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RargP18911 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RargP18911 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RargP18911 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RargP18911 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RargP18911 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RargP18911 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RargP18911 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RargP18911 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RargP18911 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RargP18911 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RargP18911 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RargP18911 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RargP18911 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RargP18911 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RargP18911 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms