Protein–RNA interactions for Protein: P16675

Ctsa, Lysosomal protective protein, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsaP16675 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtsaP16675 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtsaP16675 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtsaP16675 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtsaP16675 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtsaP16675 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CtsaP16675 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CtsaP16675 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CtsaP16675 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsaP16675 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsaP16675 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsaP16675 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsaP16675 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsaP16675 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsaP16675 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsaP16675 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsaP16675 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsaP16675 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsaP16675 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsaP16675 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsaP16675 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtsaP16675 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CtsaP16675 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtsaP16675 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CtsaP16675 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CtsaP16675 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CtsaP16675 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CtsaP16675 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtsaP16675 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtsaP16675 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtsaP16675 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtsaP16675 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CtsaP16675 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtsaP16675 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtsaP16675 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtsaP16675 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtsaP16675 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtsaP16675 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtsaP16675 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtsaP16675 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtsaP16675 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtsaP16675 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtsaP16675 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtsaP16675 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtsaP16675 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CtsaP16675 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtsaP16675 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtsaP16675 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtsaP16675 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtsaP16675 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtsaP16675 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtsaP16675 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtsaP16675 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtsaP16675 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtsaP16675 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtsaP16675 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtsaP16675 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtsaP16675 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtsaP16675 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtsaP16675 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtsaP16675 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtsaP16675 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CtsaP16675 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtsaP16675 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CtsaP16675 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtsaP16675 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtsaP16675 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms