Protein–RNA interactions for Protein: P15508

Sptb, Spectrin beta chain, erythrocytic, mousemouse

Predictions only

Length 2,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptbP15508 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SptbP15508 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SptbP15508 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SptbP15508 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SptbP15508 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SptbP15508 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SptbP15508 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SptbP15508 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SptbP15508 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SptbP15508 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SptbP15508 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SptbP15508 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SptbP15508 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SptbP15508 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SptbP15508 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SptbP15508 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SptbP15508 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SptbP15508 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SptbP15508 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SptbP15508 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SptbP15508 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SptbP15508 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SptbP15508 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SptbP15508 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SptbP15508 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SptbP15508 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SptbP15508 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SptbP15508 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SptbP15508 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SptbP15508 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SptbP15508 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SptbP15508 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SptbP15508 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SptbP15508 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SptbP15508 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SptbP15508 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SptbP15508 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SptbP15508 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SptbP15508 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SptbP15508 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SptbP15508 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SptbP15508 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SptbP15508 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SptbP15508 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SptbP15508 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SptbP15508 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SptbP15508 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SptbP15508 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SptbP15508 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SptbP15508 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SptbP15508 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SptbP15508 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SptbP15508 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SptbP15508 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SptbP15508 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SptbP15508 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SptbP15508 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SptbP15508 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SptbP15508 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SptbP15508 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SptbP15508 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SptbP15508 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SptbP15508 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SptbP15508 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SptbP15508 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SptbP15508 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SptbP15508 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SptbP15508 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SptbP15508 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SptbP15508 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SptbP15508 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SptbP15508 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SptbP15508 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SptbP15508 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SptbP15508 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SptbP15508 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SptbP15508 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SptbP15508 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SptbP15508 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SptbP15508 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SptbP15508 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SptbP15508 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SptbP15508 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SptbP15508 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SptbP15508 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SptbP15508 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SptbP15508 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SptbP15508 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SptbP15508 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SptbP15508 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SptbP15508 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SptbP15508 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SptbP15508 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SptbP15508 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SptbP15508 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SptbP15508 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SptbP15508 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SptbP15508 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SptbP15508 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SptbP15508 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms