Protein–RNA interactions for Protein: P15499

Prph2, Peripherin-2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prph2P15499 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prph2P15499 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prph2P15499 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prph2P15499 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prph2P15499 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prph2P15499 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Prph2P15499 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prph2P15499 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prph2P15499 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prph2P15499 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prph2P15499 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prph2P15499 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prph2P15499 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prph2P15499 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prph2P15499 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prph2P15499 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prph2P15499 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prph2P15499 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prph2P15499 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prph2P15499 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prph2P15499 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prph2P15499 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prph2P15499 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prph2P15499 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prph2P15499 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prph2P15499 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Prph2P15499 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prph2P15499 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prph2P15499 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prph2P15499 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prph2P15499 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prph2P15499 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prph2P15499 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prph2P15499 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prph2P15499 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prph2P15499 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prph2P15499 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prph2P15499 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prph2P15499 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prph2P15499 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prph2P15499 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prph2P15499 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prph2P15499 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prph2P15499 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prph2P15499 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prph2P15499 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prph2P15499 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prph2P15499 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prph2P15499 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prph2P15499 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prph2P15499 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prph2P15499 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Prph2P15499 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prph2P15499 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prph2P15499 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prph2P15499 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prph2P15499 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prph2P15499 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prph2P15499 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prph2P15499 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prph2P15499 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prph2P15499 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Prph2P15499 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prph2P15499 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prph2P15499 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prph2P15499 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prph2P15499 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prph2P15499 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prph2P15499 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prph2P15499 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prph2P15499 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prph2P15499 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prph2P15499 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prph2P15499 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prph2P15499 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prph2P15499 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prph2P15499 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prph2P15499 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prph2P15499 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prph2P15499 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prph2P15499 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prph2P15499 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prph2P15499 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prph2P15499 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prph2P15499 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prph2P15499 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prph2P15499 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prph2P15499 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prph2P15499 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prph2P15499 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prph2P15499 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prph2P15499 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prph2P15499 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prph2P15499 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prph2P15499 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prph2P15499 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prph2P15499 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prph2P15499 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prph2P15499 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prph2P15499 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.7 ms