Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vpreb2P13373 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Vpreb2P13373 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.7 ms