Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Calb1P12658 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Calb1P12658 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Calb1P12658 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Calb1P12658 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Calb1P12658 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Calb1P12658 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Calb1P12658 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Calb1P12658 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Calb1P12658 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Calb1P12658 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Calb1P12658 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Calb1P12658 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Calb1P12658 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Calb1P12658 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Calb1P12658 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Calb1P12658 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Calb1P12658 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Calb1P12658 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Calb1P12658 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Calb1P12658 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Calb1P12658 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Calb1P12658 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Calb1P12658 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Calb1P12658 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Calb1P12658 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Calb1P12658 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Calb1P12658 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Calb1P12658 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Calb1P12658 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Calb1P12658 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Calb1P12658 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Calb1P12658 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Calb1P12658 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Calb1P12658 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Calb1P12658 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Calb1P12658 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Calb1P12658 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Calb1P12658 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Calb1P12658 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Calb1P12658 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Calb1P12658 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Calb1P12658 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Calb1P12658 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Calb1P12658 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Calb1P12658 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Calb1P12658 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Calb1P12658 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Calb1P12658 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Calb1P12658 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Calb1P12658 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Calb1P12658 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Calb1P12658 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Calb1P12658 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Calb1P12658 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Calb1P12658 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Calb1P12658 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Calb1P12658 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Calb1P12658 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Calb1P12658 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Calb1P12658 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Calb1P12658 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Calb1P12658 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Calb1P12658 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Calb1P12658 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Calb1P12658 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Calb1P12658 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Calb1P12658 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Calb1P12658 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Calb1P12658 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Calb1P12658 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Calb1P12658 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Calb1P12658 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Calb1P12658 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Calb1P12658 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Calb1P12658 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Calb1P12658 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Calb1P12658 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Calb1P12658 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Calb1P12658 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Calb1P12658 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Calb1P12658 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Calb1P12658 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Calb1P12658 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Calb1P12658 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Calb1P12658 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Calb1P12658 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Calb1P12658 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Calb1P12658 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Calb1P12658 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Calb1P12658 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Calb1P12658 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Calb1P12658 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Calb1P12658 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Calb1P12658 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Calb1P12658 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Calb1P12658 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Calb1P12658 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Calb1P12658 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Calb1P12658 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms